Marzuki berkahwin dengan Eulis Zuraidah, seorang penyanyi keroncong Sunda dan pemimpin orkestra dari Bandung, pada tahun 1931. Isterinya menjadi inspirasi lagu Sunda beliau "Panon Hideung", yang merupakan versi Sunda Gelap Mata. Beliau kembali mengatur lagu dalam lirik baru tetapi dengan tajuk yang sama di Sunda ("Panon Hideung" bermaksud "mata hitam").[3][6]

Marzuki mengumpul alat muzik. koleksi beliau termasuk gitar, mandolin, suling, klarinet, saksofon, akordion, dan piano.[6]

Beliau dikenali sebagai seorang yang garang kebangsaan, sekali menjual gado-gado dengan isterinya dan bukannya bekerjasama dengan Nederlandsch Indie Civil Administratie Belanda bersekutu semasa Revolusi Nasional Indonesia.[5] Walau bagaimanapun, dia juga mempunyai sisi romantis, menulis lagu-lagu seperti "Kalau Anggrek berbunga" (s. 1942-1945), "Jauh di Mata Di Hati Jangan" (1947) dan "Siasat Asmara" (1948).[6]